恶性肿瘤是人类死亡的主要原因之一。随着生命科学研究的迅速发展,肿瘤细胞内的各种基本过程,如信号转导、细胞周期调节、细胞凋亡诱导、血管生成以及细胞与肿瘤微环境之间的相互作用,正在逐步阐明。随着高通量测序技术的普及和肿瘤数据共享平台的完善,泛癌研究越来越受到重视。


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泛癌研究结合并分析不同有机原蛋白的癌症,可以更深入、更广泛地了解导致癌症的一些常见信号通路的特征,并使研究人员能够专注于相对较大样本量的数据。样本量越大,数据的统计能力越强,越容易发现与癌症相关的基因组变化,因此泛肿瘤研究可能有助于发现以前从未发现的药物靶点。

图片来源:https://doi.org/10.1186/s12943-023-01752-8

近日,来自广西医学科学院的研究者们在Mol Cancer.杂志上发表了题为“Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis”的文章,该研究为进一步研究铜死亡在癌症发生发展中的作用以及基于铜死亡的靶向治疗的发展开辟了途径。

最近的研究表明,铜死亡是一种新型的细胞死亡方式,可能与癌症的发展有关。然而,没有研究表明它在肿瘤发生、进展和预后中的作用。在本研究中,研究者综合分析了铜死亡相关基因(CRG)在胰腺癌中的表达差异、基因变异和甲基化修饰。然后,使用单样本基因集富集分析(ssGSEA)来计算个体铜中毒评分(CS)。综合评估CS与拷贝数变异、临床特征、免疫相关基因、TMB、MSI和肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)的相关性。单细胞转录组测序(scRNA-seq)分析肿瘤微环境中铜中毒的激活。采用免疫组织化学(IHC)方法验证铜中毒中枢基因的表达。

研究表明,CRG在多种肿瘤中显著表达,CDKN2A在所有肿瘤中的突变频率最高(49%)。在大多数癌症中观察到CS的显著增加,并且在大多数肿瘤中与不良预后相关。在10多个肿瘤中,CS与肿瘤微环境评分呈显著负相关,在11个肿瘤中与PD-L1呈正相关,表明参与了肿瘤免疫逃逸。scRNAseq表明,癌症细胞的CRG评分显著增加。

对GTEX和TCGA联合数据库进行铜中毒途径评分分析

图片来源:https://doi.org/10.1186/s12943-023-01752-8

综上所述,该研究综合评估了铜死亡在泛癌中的作用,铜中毒参与了肿瘤发生和转移的大多数机制,并与肿瘤免疫逃逸有关。对铜中毒的综合评估有助于提高人们对肿瘤发生和肿瘤微环境重塑的理解,并为进一步研究铜中毒与肿瘤的相关性提供基础。(生物谷 Bioon.com)

参考文献

Yan Qin et al. Cuproptosis correlates with immunosuppressive tumor microenvironment based on pan-cancer multiomics and single-cell sequencing analysis. Mol Cancer. 2023 Mar 24;22(1):59. doi: 10.1186/s12943-023-01752-8.

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